闯红灯的违章行为会在发生后的计分周期内进行扣分。
具体来说,当驾驶人的计分周期结束后,只有处理完所有违章行为并缴纳相应罚款,记分才会被清零。根据《机动车驾驶证申领和使用规定》,道路交通安全违法行为的处罚与记分是同时执行的。如果驾驶人在一次违章中有多个违法行为,那么会分别计算并累加分值。此外,如果驾驶人对处罚有异议并成功申请行政复议或提起行政诉讼,且经裁决后原处罚决定被变更或撤销,那么相应的记分分值也会得到变更或撤销。最后,如果驾驶人在一个记分周期内的记分未达到12分,并且已经缴纳了所有罚款,那么记分将被清除。否则,未缴纳的罚款对应的记分将会转入下一个记分周期。