公司车辆违章处理方式有多种，以下是其中两种常见的方法：

第一种方式是到车管所的违章窗口处理。公司车辆违章驾驶人需要带上车辆的行驶证、自己的驾驶证和身份证到车管所的违章窗口领号排队，提交相关资料并签认处罚决定书。

在领到处罚决定书之日起的十五天内缴纳罚款即可。这种方式需要驾驶人亲自到场，比较麻烦，但是处理效率高，可以当场消除违章记录。

第二种方式是登陆网上车管所界面，在左侧的“在线办理事项”找到“交通违法”一项，点击进去就可以看到交通违法查询、确认及罚款。有一个“机场车违法查询”选项，可以查询到没有在网上车管所注册的车辆。

只要输入车辆发动机号以及车辆识别代码等，可以找到最新的车辆违章信息。这种方式方便快捷，但是需要注意的是，办理异地服务违章处理会收取一定的服务费。

对于公司车辆的违章处理，按照谁开车谁负责的原则，让违规的驾驶人去处理。驾驶人需要携带违章车辆行驶证、身份证、驾驶证以及驾驶人本人到场。在确定自己确实违章之后，驾驶人本人需要亲自到场，带上以上三种证件去车管所或者交警大队处理即可。

这种方式可以避免不必要的麻烦，但是需要注意违章记录的及时处理，以免影响公司的形象和信誉。

总之，无论是哪种方式，都需要遵守交通管理规定，确保行车安全，降低事故的发生率。建议驾驶人平时注意安全驾驶，避免违章行为的发生，以免给自己和公司带来不必要的麻烦。