对于员工上下班交通事故非主要责任的情况，公司应当承担工伤赔偿责任。根据《工伤保险条例》第三十六条的规定，公司需要支付工伤保险待遇，包括治疗工伤期间的工资福利、终止或解除劳动合同时的一次性伤残就业补助金以及五级、六级伤残职工按月领取的伤残津贴。但是，如果员工醉酒、吸毒、故意犯罪、自残或自杀等情况下，公司不需要承担赔偿责任。具体赔偿标准为：五级伤残为18个月的本人工资，六级伤残为16个月的本人工资。如果用人单位难以安排工作，需要按照规定为员工缴纳各项社会保险费。如果员工提出解除或终止劳动关系，工伤保险基金支付一次性工伤医疗补助金，用人单位支付一次性伤残就业补助金。需要注意的是，具体赔偿标准由省、自治区、直辖市人民政府规定。

如果员工因工致残被鉴定为五级或六级伤残，将享受以下待遇：从工伤保险基金按伤残等级支付一次性伤残补助金，标准为五级伤残为18个月的本人工资，六级伤残为16个月的本人工资。同时，员工可以保留与用人单位的劳动关系，由用人单位安排适当工作。如果难以安排工作，用人单位需要按月发给伤残津贴，标准为五级伤残为本人工资的70%，六级伤残为本人工资的60%。如果伤残津贴实际金额低于当地最低工资标准，用人单位需要补足差额。

需要强调的是，如果员工因工致残被鉴定为五级或六级伤残，经工伤职工本人提出，可以与用人单位解除或终止劳动关系，由工伤保险基金支付一次性工伤医疗补助金，由用人单位支付一次性伤残就业补助金。具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定。总之，公司在员工上下班交通事故非主要责任的情况下需要承担相应的工伤赔偿责任，具体赔偿标准和待遇需要根据法律规定和当地政策进行确定。