摩托车驾驶证和C1驾驶证的扣分问题,可以通过合并后的驾驶证来解决。根据《机动车驾驶证申领和使用规定》,公安机关交通管理部门对机动车驾驶人的道路交通安全违法行为实行累积记分制度,记分周期为12个月,满分为12分。机动车驾驶人在一个记分周期内记分达到12分时,需要按规定参加学习和考试。
此外,根据《中华人民共和国道路交通安全法》规定,公安机关交通管理部门对机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规的行为,除了依法给予行政处罚外,同样实行累积记分制度。当机动车驾驶人的累积记分达到规定分值时,公安机关交通管理部门会扣留其机动车驾驶证,并对其进行道路交通安全法律、法规教育,然后进行重新考试。考试合格后,机动车驾驶证会被发还。