当发生科目三撞车事故时，应该采取以下措施：

首先，可以选择报警。交通部门会对事故责任进行认定，然后依据交强险进行赔偿。如果赔偿不足，按照责任承担，学员需要承担部分责任，驾校也需要承担一部分责任。

根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》，接受机动车驾驶培训的人员，在培训活动中驾驶机动车发生交通事故造成损害，属于该机动车一方责任，当事人请求驾驶培训单位承担赔偿责任的，人民法院应予支持。

其次，学员在驾驶培训机构学习期间，在教学活动中，驾驶教练车发生道路交通事故致人损害，由驾驶培训机构承担赔偿责任。

根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第五条，学员在驾驶培训机构学习期间，驾驶教练车发生道路交通事故致人损害，由驾驶培训机构承担赔偿责任。

此外，根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第二十条，在道路上学习驾驶，应当按照公安机关交通管理部门指定的路线、时间进行。在教练员随车指导下进行学员在学习驾驶中有道路交通安全违法行为或者造成交通事故的，由教练员承担责任。

总之，在科目三撞车事故发生后，应该及时报警，由交通部门认定责任，交强险赔偿后，不足部分按照责任承担，学员和驾校承担相应的责任。同时，驾驶培训机构也需要承担相应的赔偿责任。这些法律规定和解释为驾驶培训单位和驾驶学员提供了指导和保障。